Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp8Q8BMJ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sp8Q8BMJ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sp8Q8BMJ8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms