Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtripQ8BMG1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms