Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcal1Q8BJL0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms