Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms