Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmco3Q8BH01 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco3Q8BH01 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms