Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Ubash3bQ8BGG7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Ubash3bQ8BGG7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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