Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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