Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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