Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG22

Clca2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca2Q8BG22 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca2Q8BG22 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clca2Q8BG22 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca2Q8BG22 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms