Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnpo1Q8BFY9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo1Q8BFY9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms