Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atg4cQ811C2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms