Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem39bQ810L4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms