Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc155Q80VJ8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc155Q80VJ8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc155Q80VJ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc155Q80VJ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc155Q80VJ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc155Q80VJ8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc155Q80VJ8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc155Q80VJ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc155Q80VJ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc155Q80VJ8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc155Q80VJ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms