Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3gap1Q80UJ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab3gap1Q80UJ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms