Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms