Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lamp3Q7TST5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms