Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnf1Q7TSH7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms