Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctdp1Q7TSG2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctdp1Q7TSG2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms