Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms