Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms