Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ShprhQ7TPQ3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms