Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Prrc2bQ7TPM1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms