Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mycbp2Q7TPH6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms