Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpf1Q7TND5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf1Q7TND5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms