Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkd1l2Q7TN88 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms