Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyfip1Q7TMB8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms