Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwistnbQ78WZ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TwistnbQ78WZ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms