Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sys1Q78S06 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sys1Q78S06 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sys1Q78S06 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms