Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GypcQ78HU7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GypcQ78HU7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms