Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mindy1Q76LS9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mindy1Q76LS9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms