Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nme8Q715T0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms