Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms