Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup188Q6ZQH8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup188Q6ZQH8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms