Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms