Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NinlQ6ZQ12 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NinlQ6ZQ12 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms