Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chsy1Q6ZQ11 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms