Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h4Q6ZPZ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms