Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms