Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scgb2b2Q6UGQ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms