Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc1Q6TDU8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms