Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms