Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudcd1Q6PIP5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudcd1Q6PIP5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms