Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc57Q6PHN1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc57Q6PHN1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms