Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad54bQ6PFE3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms