Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup98Q6PFD9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms