Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dhx40Q6PE54 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms