Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm2lQ6PDS0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms