Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM1

Msl1, Male-specific lethal 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl1Q6PDM1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msl1Q6PDM1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msl1Q6PDM1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msl1Q6PDM1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms