Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms