Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trak1Q6PD31 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trak1Q6PD31 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trak1Q6PD31 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trak1Q6PD31 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Trak1Q6PD31 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trak1Q6PD31 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms