Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Papd7Q6PB75 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Papd7Q6PB75 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms